Une introduction en douceur à la science ouverte

Cet été, j’ai eu le plaisir de participer à la Société des ornithologistes du Canada à Saskatoon au Canada. C’était génial de croiser Sunny Tseng, Championne rOpenSci et collègue ornithologiste! Ce n’est pas souvent que je rencontre les deux types de collègues (développeur·se·s R et ornithologistes) lors d’une même conférence, alors je chéris ces expériences.

Avant de rejoindre rOpenSci, j’ai commencé ma carrière professionnelle en tant qu’écologiste comportementale et ornithologiste, étudiant les effets du bruit urbain et de l’habitat sur la communication chez les mésanges. Alors que je me suis reconvertie dans le conseil et l’assistance en matière de R ainsi que le travail avec Yani ici à rOpenSci avec notre incroyable communauté, je travaille encore aujourd’hui principalement pour d’autres ornithologistes ou des organisations à but non lucratif de conservation des oiseaux.

Cela signifie que la Société des ornithologistes du Canada est toujours mon organisation d’origine et je suis toujours enthousiaste à l’idée d’assister à des réunions et de renouer avec mes collègues. Mais conférence ornithologique ou pas, j’essaie toujours d’apporter un peu de R, de Science Ouverte et de rOpenSci à la réunion.

Dans le passé, j’ai organisé des symposiums sur des sujets tels que “R pour les ornithologues : Points de vue des utilisateuRs et programmeuRs” ou “Comment les ornithologues peuvent-il·elle·s trouver des paquets R ?” et j’ai participé à l’organisation d’ateliers sur les paquets R pour l’ornithologie (comme bbsBayes2).

Cette année, j’ai eu envie d’aller un peu plus loin que R et j’ai décidé de parler de “Conseils pratiques pour la science ouverte en ornithologie”. Mon objectif était d’encourager les ornithologistes (ou d’autres scientifiques) à essayer la science ouverte. Pour se rendre compte qu’il n’est nécessaire ni d’avoir une formation en informatique, ni d’avoir beaucoup d’argent ! Et comme l’ornithologie compte de nombreux scientifiques qui travaillent déjà avec des données ouvertes, des méthodes ouvertes et la science ouverte, je voulais partager quelques idées sur la manière dont il·elle·s pourraient encourager un plus grand nombre de leurs collègues à se joindre à elleux.

Pour la communauté rOpenSci, il s’agit d’un véritable “retour aux sources”. Les conversations que nous avons portent plus souvent sur la façon dont on peut devenir meilleur·e en science ouverte ? Comment rendre cette étude complètement reproductible ? Comment améliorer la qualité du code ouvert¹?

Mais je pense que nous oublions parfois qu’en plus du temps, des compétences et parfois du financement, la pratique de la science ouverte demande beaucoup de courage².

Pour celleux qui débutent (comme les étudiant·e·s) ou celleux qui n’ont pas de soutien en matière de science ouverte (comme les chercheur·se·s des petites institutions), la pratique de la science ouverte peut sembler écrasante et extrêmement intimidante. Il est effrayant de penser aux critiques si l’on ne “fait pas de la science ouverte correctement”, ou aux conséquences si l’on commet une erreur.

J’ai voulu mettre l’accent sur les petits pas, pour qu’il soit clair que c’est l’effort qui est important, et non la perfection !

En plus de quelques conseils pratiques, j’ai donc donné quatre conseils généraux :

1. Ne pas essayer de tout faire

   • Soyez gentil·le avec vous-même
   • Vous avez le droit de commencer petit et de grandir !

2. Faites une nouvelle chose

   • Pour chaque projet, essayez d’élargir vos compétences, d’apprendre une nouvelle chose.

3. C’est normal d’être nerveux·se

   • Les erreurs arrivent, mais n’oubliez pas qu’en pratiquant la science ouverte, vous êtes déjà génial·e !

4. Travailler avec d’autres

   • Trouver sa communauté

Je pense que ce qui m’a le plus plu dans cette conférence, c’est le nombre d’étudiant·e·s qui sont venu·e·s me parler par la suite, enthousiastes (et nerveux·ses) à l’idée de commencer à partager leur code en ligne. Il·elle·s m’ont posé de nombreuses questions, qu’il s’agisse de questions pratiques sur l’utilisation de GitHub ou de questions générales sur la qualité de leur code pour qu’il soit partagé. Ma réponse à cette dernière question a été : “Si vous l’avez utilisé, partagez-le. (Mais annotez-le énormément !)”

Quels sont vos conseils préférés pour encourager la science ouverte ?

🔗 Remerciements

Remerciements à Alex Koiter pour les idées et le remue-méninges pour mon exposé, ainsi que pour son exposé génial (et beaucoup plus long), Open and Reproducible Soil Science.